EN

业务相关咨询电话:

临床检测:400-605-6655
科研服务:400-706-6615
司法服务:400-900-2616
bt365体育客户端仪器:400-096-6988

前台电话:+86-755-36307888

传真:+86-755-36307273
客服邮箱:info@genomics.cn
媒体联络:media@genomics.cn
地址:深圳市盐田区北山工业区11栋(518083)

      

    新闻中心

新闻中心

及时播报华大科研、教育、产业等方面的相关资讯

首页 华大概况 新闻中心 会务活动 单细胞组学实用技术分析培训班

单细胞组学实用技术分析培训班

发布日期:2019/04/19 浏览次数:

举办地点:深圳.华大总部

培训时间:2019516-19


    单细胞bt365体育客户端是指通过对单个细胞不同组学层面,如基因组、转录组及表观基因组等进行高通量bt365体育客户端,获得单细胞分辨率的数据信息,进而进行细胞身份鉴定、新细胞类型发现、时序分析等的bt365体育客户端技术。单细胞bt365体育客户端可以解决用多细胞样本bt365体育客户端无法解决的细胞异质性难题,为解析细胞群体中单个细胞的行为、机制及其与机体的关系等提供了新方法。

    为此,华大学院特开设《单细胞组学实用技术分析培训班》,将华大宝贵的前沿技术经验分享给各位同仁。本期讲师团队长期从事单细胞bt365体育客户端数据分析,在组学领域积累很丰富的项目经验。


课程说明:自备电脑,推荐使用Maclinux操作系统的笔记本电脑!CPU 2G以上,内存4G以上,电脑请自备连接有线网络的端口。


【培训目标】

帮助学员学习掌握:


  •         多组学科学研究思路、项目设计方法
  •         单细胞转录组bt365体育客户端的基础分析以及高级数据分析
  •         多组学整合分析



【培训优势】


  •         一流的讲师——丰富的科研经验、重大项目执行经验
  •         全面的课程——技术原理、分析流程&技术应用相互结合
  •         全新的方法——使用开源的软件&分析流程,更方便、快捷
  •         面对面解决问题——与信息分析、数据挖掘达人面对面探讨项目中的瓶颈问题

【课程内容】


日期

时间

课程

内容

形式

/

/

预习资料

《新一代bt365体育客户端技术原理》-112mins

视频自学

Linux 操作系统基础 》-40mins

第一天

9:00-12:00

科研项目设计

1. 单细胞组学技术发展历程和原理介绍

理论

2. 单细胞组学技术在科研中的应用:
   
设计思路和案例介绍

3. 单细胞组学和多组学整合分析思路
   
和案例介绍

14:00-15:30

精准医疗之
蛋白质组-转录组整合分析
蛋白质组-代谢组整合分析

1. 热点、流程介绍、案例解析

理论

2. 文章作图

15:45-18:00

单细胞建库原理与操作

1. 样本获取和保存

理论

2. 单细胞实验处理、建库、bt365体育客户端

3. 获取单细胞表达矩阵(RNA-seq 流程)

第二天

9:00-12:00

R安装、
数据处理分析与绘图

1. R语言简介及安装,RStudio的安装
   
及使用说明

理论+实操

2. R语言语法介绍及常用命令

14:00-18:00

3. 数据处理功能及统计应用

4. R语言画图实操及ggplot2介绍、实操

第三天

9:00-18:00

单细胞
转录组绘图和结果解读

1. 聚类分析

理论+实操

2. marker gene等高级分析

3. 时序分析

第四天

09:00-12:00

多组学整合分析和结果解读

1. 转录组,基因组,表观分析介绍

理论+实操

2. RNA and ATAC-seq等多组学整合分析

14:00

深圳国家基因库

集合乘车前往深圳大鹏国家基因库

参观考察

15:00-16:30

统一参观深圳大鹏国家基因库

16:45

集合乘车返程

【注】 :深圳市华大基因学院保留对以上课程信息(包括主题、课程安排和其他细节等)进行调整的权利,具体课程信息以实际上课为准。


【培训对象】

从事单细胞研究(如利用单细胞组学技术进行癌症,发育,疾病机制研究)的科研工作者和高校师生


【讲师团队】

注:排名不分先后,按姓氏首字母排序;


刘石平,遗传学博士。2015年毕业于华南理工大学。自2009年加入华大研究院,从事单细胞基因组学、群体遗传学、比较基因组学等生物信息研究工作8年多。

参与众多国际重大的基因组学重大科研项目,如大熊猫基因组、北极熊群体基因组、G10K、癌症单细胞计划、Human Cell Atlas等。曾获中国青少年科技创新奖,深圳市高层次人才,深圳市盐田区生物产业高层次人才(优秀人才)。

目前主要研究单细胞多组学、脑科学等前沿领域。近五年已发表SCI论文14篇,其中Cell, Nature,Science CNS7篇,以第一作者或并列第一作者发表论文5篇。


以下展示部分发表文章:

1. Zhao Z,Goldin L, Liu S, Wu L, Zhou W, Lou H, et al. Evolution of multiple cell clonesover a 29-year period of a CLL patient. Nat Commun. 2016;7: 13765.doi:10.1038/ncomms13765.

2. Liu, S.,Lorenzen, E. D., Fumagalli, M., Li, B., Harris, K., Xiong, Z., … Wang, J. (2014). Population genomics reveal recent speciation andrapid evolutionary adaptation in polar bears. Cell, 157, 785794. doi:10.1016/j.cell.2014.03.054. 

3. Jex, A.R., Liu, S., Li, B., Young, N. D., Hall, R. S., Li, Y., … Gasser, R. B. (2011). Ascaris suum draft genome. Nature.doi:10.1038/nature10553.

4. Young, N. D.,Jex, A. R., Li, B., Liu, S., Yang, L., Xiong, Z., … Gasser, R. B. (2012).Whole-genome sequence of Schistosoma haematobium. Nature Genetics.doi:10.1038/ng.1065.


刘龙奇,细胞生物学博士,2015年毕业于中国科学院。现任华大生命科学研究院单细胞组学实验室负责人。同时担任西北大学兼职教授,郑州大学兼职副教授,华大基因学院高级讲师。曾获中科院院长奖学金,深圳市高层次人才,深圳市盐田区“梧桐人才”。

目前主要负责高通量单细胞多组学bt365体育客户端新技术和产品研发工作,在细胞命运转变,表观遗传学,基因表达调控,单细胞多组学整合分析等方面具有丰富的经验。

5年来以第一或通讯作者在Cell Stem Cell, Nature Materials, Nature Communications等杂志上发表论文或评论多篇。


以下展示部分发表文章:

1. Liu L, Xu Y,He M, Zhang M, …, Esteban MA. (2014).Transcriptional pause release is a rate-limiting step for somatic cellreprogramming. Cell Stem Cell 15, 574-588.

2. Xu Y, Liu L#,Laslett AL, Esteban MA#. (2013). Cell reprogramming: Into the groove. NatureMaterials 12, 1082-1084. 

3. Liu L, Liu C,… Xun Xu. (2018) Deconvolution of Single-cellmulti-omics layers reveals regulatory heterogeneity. Nature Communications.10(1): 470.

4. Liu L, Leng L,… GeL. (2018). An integrated chromatin accessibility and transcriptome landscape ofhuman pre-implantation embryos. Nature Communications. 10 (1): 364.


戚达, 计算机科学博士, 华大基因蛋白质方向资深课程顾问,蛋白质组学研究专家。2008年获得威尔士大学计算机科学博士学位。2011年在英国利物浦大学开始从事蛋白质组学信息分析研究,主要参与欧盟第七框架计划资助的ProteomeXchange项目,作为HUPO-PSI工作组的成员,制定蛋白质组学标准数据格式,包括定量蛋白质组标准mzQuantML,代谢组标准mzTab等格式的制定,开发与Pride数据库相关的软件。2016年负责英国生物技术和生物科学研究理事会(BBSRC)牛顿基金资助的英国-中国-泰国-菲律宾-越南可持续水稻计划项目,开发生物信息分析流程,利用蛋白基因组学方法,提高水稻基因注释的可靠性以及发现新的未知基因。2017年加入华大基因,担任蛋白质生物信息平台负责人。主攻基于质谱的蛋白质组学,代谢组学数据标准化建设,大数据深度挖掘,智能生物信息分析系统开发。截至当前,在国际着名学术期刊发表文章10余篇,开发商业化软件ProteoLabels的原型。具有丰富的生物信息分析经验和项目经验,教学举一反三。

以下展示部分发表文章:

1.    Z. Ren, D. Qi, N. Pugh,K. Li, B. Wen, R. Zhou, S. Xu, S. Liu, A. R. Jones, Improvements to the ricegenome annotation through large-scale analysis of RNA-Seq and proteomicsdatasets, Molecular and Cellular Proteomics, November 2018,mcp.RA118.000832; https://doi.org/10.1074/mcp.RA118.000832.

2.     D. Qi, C. Lawless,J. Teleman, F. Levander, S. W. Holman, S. Hubbard, A. R. Jones, Therepresentation of selected-reaction monitoring data in the mzQuantML datastandard, Proteomics, 2015, 15(15): 2592-96. doi:10.1002/pmic.201400281.

3.     D. Qi, R.Krishna, A. R. Jones. The jmzQuantML programming interface and validator forthe mzQuantML data standard, Proteomics, 2014, 14(6): 685-8.doi:10.1002/pmic.201300281.


夏军,华大智造项目经理,主要负责胚胎植入前检测以及单细胞bt365体育客户端方向产品的研发。

先后负责孕妇外周血胎儿有核红细胞分离应用,胚胎植入前遗传传学筛查试剂盒开发、胚胎植入前胚胎单基因病和染色体异常一体化检测技术开发与stLFR建库试剂盒开发等项目。

已发表SCI文章3篇,申请专利4项。在胚胎植入前检测和单细胞建库bt365体育客户端方向有丰富的经验。


【注册费】

注册费:5000/


注:

1、费用含包括学费、资料费、实操练习费、其他材料费及午餐费;

2、培训期间可协助安排住宿,住宿费用自理;


【优惠政策】

1.华大业务合作伙伴/培训班老学员,可享9.5折优惠,即:4750/人;

2. 转发分享此文至朋友圈并带上【报名参加】的评论,可享9折优惠,即:4500/人;

3. 5人及以上团体报名参加本期培训,可享8折优惠,即:4000/人;


注:以上三项优惠不能同时使用,最终优惠解释权归华大学院所有!


【报名方式】

长按识别二维码,填写报名信息,提交并支付,即可报名成功。

【注意事项】

1. 报到通知

报名成功者,将会在5918:00之前收到会务组的邮件报到通知。

为方便大家报名,可提前下载本期培训的《会议通知》或《培训通知》用于申请经费,点击链接,即可下载。

会议&培训通知

链接:https://pan.baidu.com/s/1dy9sCIM_zF12uyBsBF5bdQ

提取码: nk3f


2. 支付方式

可通过微信/支付宝/银行汇款三种方式支付培训费。

若您选择银行汇款请在5918:00前转账汇款,逾期不保留名额。

*** 汇款信息 *** (国内)
人民币:XX 元(请根据个人报名情况进行相应金额的汇款)
  行:中国工商银行深圳保税区支行
开户名称: 深圳市华大基因学院
 号:4000 0255 0920 0144415

汇款时请务必标明“单细胞+姓名”

成功汇款后将您的汇款凭证扫描或拍照后发到邮箱training@service.genomics.cn

3. 发票

2019年5918:00前付款可在培训期间获取发票。

请务必准确填写报名表单的发票信息,因个人填写信息错误导致发票有误,不予重开!发票信息建议提前与贵单位财务部门确认。

4. 结业证书

完成培训的学员,将获得由深圳市华大基因学院颁发结业证书。


【联系方式】

时间:周一至周五  9:00-12:00,14:00-18:00

电话:0755-36352044  韩老师 桂老师

邮箱:training@service.genomics.cn